Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Cldn34c3J3QJW5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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