Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nccrp1G3X9C2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms