Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Srp72F8VQC1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp72F8VQC1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Srp72F8VQC1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Srp72F8VQC1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Srp72F8VQC1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp72F8VQC1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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