Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28038F7BCN9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms