Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8444F6XS56 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8444F6XS56 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms