Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm340F6RGI3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms