Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7bE9Q9Y3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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