Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tarbp1E9Q368 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tarbp1E9Q368 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms