Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pdzd2E9Q1M1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Pdzd2E9Q1M1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pdzd2E9Q1M1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pdzd2E9Q1M1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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