Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc1E9Q043 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc1E9Q043 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms