Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5415E9PXF3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms