Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930455H04RikD3Z622 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930455H04RikD3Z622 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms