Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tgfbr3lD3YZZ2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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