Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm4950D3YUM8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4950D3YUM8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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