Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3259D3YUK0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3259D3YUK0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms