Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms