Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd8B9EJ80 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd8B9EJ80 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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