Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20547B8JJN0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20547B8JJN0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms