Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11cB4XVP9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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