Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usf3B2RUQ2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf3B2RUQ2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms