Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Brpf1B2RRD7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf1B2RRD7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms