Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trabd2bB1ATG9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trabd2bB1ATG9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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