Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem235B1AQL3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms