Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem238A9JSM3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms