Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttll11A4Q9F4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ttll11A4Q9F4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms