Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Odf2A3KGV1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms