Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm5640A3KG49 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm5640A3KG49 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5640A3KG49 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5640A3KG49 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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