Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH7

Apol8, Apolipoprotein L 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol8A2VDH7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apol8A2VDH7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol8A2VDH7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms