Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb1A2AQ07 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb1A2AQ07 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms