Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CtcflA2APF3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CtcflA2APF3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CtcflA2APF3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CtcflA2APF3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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