Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm12A2AJ77 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms