Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prdm2A2A7B5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm2A2A7B5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms