Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdc27A2A6Q5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms