Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l1A2A259 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms