Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trbv30A0A0B4J1P1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trbv30A0A0B4J1P1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trbv30A0A0B4J1P1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Trbv30A0A0B4J1P1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Trbv30A0A0B4J1P1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Trbv30A0A0B4J1P1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trbv30A0A0B4J1P1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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