Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3550W4VSN7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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