Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac5Q9Z2V6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac5Q9Z2V6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms