Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf3Q9Z2L7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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