Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms