Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddx39bQ9Z1N5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms