Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ror1Q9Z139 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ror1Q9Z139 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms