Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip2Q9Z0H8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clip2Q9Z0H8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms