Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13bQ9WU72 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13bQ9WU72 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms