Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrf1Q9WU00 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrf1Q9WU00 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms