Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp18Q9WTV6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp18Q9WTV6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms