Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sept6Q9R1T4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms