Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubd1Q9R1K7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubd1Q9R1K7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms