Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ntn3Q9R1A3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ntn3Q9R1A3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ntn3Q9R1A3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ntn3Q9R1A3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ntn3Q9R1A3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ntn3Q9R1A3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ntn3Q9R1A3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ntn3Q9R1A3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ntn3Q9R1A3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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