Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod1Q9R0E2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms