Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp11cQ9QZW0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms